精灵宝可梦，简称宝可梦，这颗星球上非常非常不可思议的生物，在天空、大海、森林、街道之中到处都能看到它们的身影。持有不可思议吊坠的来自帕底亚的少女——莉可。持有神秘精灵球的来自关都的少年——罗伊。以广阔的宝可梦世界为舞台，莉可和罗伊的新冒险开始了！等待两人的相遇，还有命运是—！？这是一个通过冒险“找到”重要的东西的故事。...

与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！...

第四次忍界大战结束的两年后，此时此刻的漩涡鸣人（竹内顺子配音）早已成为盖世英雄一般的人物，无论他走到哪里都受到女孩子和小朋友的喜爱与追捧，他似乎也有其享受这样喧嚣欢闹的氛围。与之相对，壁花小姐日向雏田（水树奈奈配音）则始终站在角落里，默默注视着这个她喜欢了多年的男孩子。雏田亲手为鸣人织了围巾，怎奈无法鼓足勇气交给对方，喜欢的话语更难以说出口。某个夜晚，雏田的妹妹花火（浅井清己配音）遭到不明身份之人...