故事发生在日本的江户时代，一名神秘的男子出现在了武士桂小太郎（石田彰配音）的面前，他手握妖刀“红樱”，要求试刀，这个夜晚之后，桂便下落不明。桂的宠物伊丽莎白（高松信司配音）找到万事屋的神乐（钉宫理惠配音）和新八（坂口大助配音），委托他们寻找主人的下落。同时，银时（杉田智和）也受到委托，寻找四处作恶的红樱的下落。三人的线索汇聚到了一艘空中飞艇上，由于远离警察的管辖范围，飞艇里的恶势力一手遮天。在...

为追踪4名血继限界继承者的下落，小樱（中村千絵配音）、漩涡鸣人（竹内顺子配音）、卡卡西（井上和彦配音）和佐井奉命前往。但在岩隐和草隐交界的须弥山失去目标，鸣人和佐井也身受重伤。在此之后，自称卑留呼（保志総一朗配音）的前木叶村忍者单方面宣战，他之前因修习鬼芽罗术而被逐出木叶，而今他企图集齐5个血继限界成为不死的完美忍者，进而发起第四次忍界大战。在此危急时刻，卡卡西感受到来自卑留呼的召唤。失去最重要的...

为了追踪叛忍百足，五代目火影网手（胜生真沙子配音）命令大和（小山力也配音）率领小樱（中村千絵配音）、漩涡鸣人（竹内顺子配音）、佐井（日野聪配音）等人前往楼兰。楼兰某处地下藏有蕴含巨大能量的龙脉查克拉，很久以前被第四代火影封印。而百足的目标则是解开封印，释放恐怖的力量。经过千钧一发的搏斗，鸣人变成孤身一人，他意外来到一座繁华的失落城市，在此遭到了傀儡部队的袭击，并得到神秘木叶忍者的救助。之后鸣人邂逅...

某日，一群使用风遁之术的空忍空袭火之国，无数民众和忍者遇害，形势危急。据纲手大人所言，这群不速之客正是在第二次忍者大战中落败的空之团，如今他们怀着复仇之心再次出现。卡卡西（井上和彦配音）等人则负责侦查空之团的老巢，鸣人（竹内顺子配音）、小樱（中村千绘配音）、雏田（水樹奈々配音）受命组成三人医疗小队，协助名医神农（石塚運昇配音）前往其徒弟雨琉的家乡医治伤者。另一方面，病入膏肓的大蛇丸得知神农的再生之...

幽灵军团的黄泉（中村秀利配音）通过神秘的暗黑医疗术，复活了具有足以毁灭世界恐怖力量的魔物魍魉（加藤精三配音），希望以此建立黑暗的千年王国。魍魉俯身于黄泉身上，随即命令幽灵军团攻打鬼之国，企图杀害具有封印魔物和预言死亡能力的巫女紫苑（藤村歩配音），并准备夺回魍魉封印在沼之国的肉体。一旦魍魉的灵魂和肉体合二为一，世界将彻底灭亡。鬼之国遇袭的消息很快传到其他各国，叶隐村的忍者也被调动起来。鸣人（竹内顺子...

第四次忍界大战结束的两年后，此时此刻的漩涡鸣人（竹内顺子配音）早已成为盖世英雄一般的人物，无论他走到哪里都受到女孩子和小朋友的喜爱与追捧，他似乎也有其享受这样喧嚣欢闹的氛围。与之相对，壁花小姐日向雏田（水树奈奈配音）则始终站在角落里，默默注视着这个她喜欢了多年的男孩子。雏田亲手为鸣人织了围巾，怎奈无法鼓足勇气交给对方，喜欢的话语更难以说出口。某个夜晚，雏田的妹妹花火（浅井清己配音）遭到不明身份之人...

刚刚结束了与叛忍集团“晓”的抗争，木叶村被一股诡异不祥的气氛所笼罩。此时此刻，漩涡鸣人（竹内顺子配音）沉浸在对家人的思念中，孤独无助。某个晚上，心情糟糕的鸣人巧遇刚刚和家人吵架的小樱（中村千绘配音），二人在公园闲聊之际，神秘的斑（内田直哉配音）突然出现，并向二人使出瞳术。眩晕过后，鸣人和小樱发现看似一如平常的木叶村，曾经熟悉的伙伴竟然性格发生巨变。一连串不正常的事件令二人苦恼不已。更令人难以置信的...

十多年前一只拥有巨大威力的妖兽“九尾妖狐”袭击了木叶忍者村，当时的第四代火影拼尽全力，以自己的生命为代价将“九尾妖狐”封印在了刚出生的鸣人身上。木叶村终于恢复了平静，但村民们却把鸣人当成像“九尾妖狐”那样的怪物看待，所有人都疏远他。鸣人自小就孤苦无依，一晃十多年过去了，少年鸣人考入了木叶村的忍者学校，结识了好朋友佐助和小樱。佐助是宇智波家族的传人之一，当他还是小孩的时候他的哥哥——一个已经拥有高超...

吾郎想在圣秀建立一个棒球社打败海堂，但是圣秀高中从几年才从女校改成男女合校，所以学校男生人数根本不到十个，在吾郎好说歹说下，大家终於愿意加入棒球社，在吾郎的爸爸茂野的训练下，打算在3年级时参加比赛，但在一次因缘际会下，球队监督连络到了海堂的2军，於是他们之间开始了一场练习赛，江头在比赛中故意指使一个球员踩伤吾郎的脚，害的吾郎在县内比赛开始时以负伤的情况参加，一路努力终於打到了县内决赛，圣秀V.S海...

第四季终于进入美国篇，为了成为美国职业棒球手的吾郎只身前往美国。他刚一下飞机就遇到了小麻烦，一位名叫八木沼隼人的大学生帮助了他。八木和吾郎一样立志成为职业棒球手，于是两人便一同参加专业团体sammons的入团考试……吾郎的前进途中可谓困难重重，站上3A投手板的他，不得不与某个命中注定相遇的打手对峙。打手名为乔·吉普森·朱尼尔，正是那个“吉普森·朱尼尔”的儿子，不知为何，他莫名的憎恨着吾郎。这究竟是...